东北师范大学体育学院共开设五个专业学科的硕士点，分别为体育教育训练学、体育人文社会学、运动人体科学、课程与教学论、民族传统体育学。其中体育教育训练学下设4个研究方向：体育教育教学训练原理与方法、体育教学训练管理理论与方法、运动训练理论与方法和体育教育训练理论与方法。体育人文社会学下设5个研究方向：体育教育学、体育健康原理与方法、体育心理学、体育科学研究方法和体育发展史。运动人体科学下设4个研究方向：运动生物学、运动解剖学、运动生理学和运动医学。课程与教学论下设6个研究方向：体育教育原理、田径运动教学理论与方法、体操运动教学理论与方法、篮球运动教学理论与方法、排球运动教学理论与方法和速滑运动教学理论与方法。民族传统体育学下设4个研究方向：中华武术发展史、防身术与民族传统武术研究、养生与太极拳的开发与应用研究和武术教学、训练原理与方法。